Doğumsal kalp hastalığı ile doğan çocukların %90’dan fazlasının yetişkinlik çağına erişmesi ve sonrasında da yaşamlarını sürdürmesi öngörülmektedir.
Doğumsal kalp kusurunun etkileri, çocuğun kalp kusurunun tipine ve ciddiyetine bağlıdır. Doğumda, doğuştan kalp kusuru tanısı alan çocuklar, zayıf kan dolaşımı, yorgunluk veya hızlı nefes alma gibi sorunlarla karşılaşabilirler. Doğumsal kalp kusurları karmaşık hastalıklardan daha basit hastalıklara kadar değişmektedir. Bazılarının tıbbi durumları daha riskli olabilir. Doğumsal kalp hastalıkları, farklı sendrom türleriyle ilişkilendirilebilir veya diğer organ sistemlerini de etkileyebilir.
Doğumsal kalp hastalıkları ile doğan çocukların nörolojik gelişimleri etkilenebilir. Çalışmalar, çoğu zaman bilişsel işlevin normal aralıkta olduğunu ancak karmaşık bir görevi planlama ve gerçekleştirme becerisi olan yürütme işleviyle ilgili sorunlar olduğunu göstermektedir. Günümüzde doğuştan kalp hastalığı olan çocuklar yetişkinlik çağlarına kadar iyi bir yaşam sürmektedir.
Bu nedenle kalp rahatsızlığı olan çocukların ömür boyu doktor tarafından takip edilmesi önerilmektedir.